Върховен орган на СЕЕС е Общото събрание, в което са представени всички структурни звена и колективни членове.
Общото събрание се свиква от Управителния съвет на всеки три години.
Управителен съвет
проф. дтн. инж. Иван Стоянов Ячев - председател на СЕЕС
доц. д-р инж. Сеферин Тодоров Мирчев - зам. председател
на СЕЕС
доц. д-р инж. Иван Николов Василев - изпълнителен директор